文件柜通常用于存放一些普通的档案、文件或是资料，而档案柜则更加注重保密性与安全性，并有特殊的维护和管理方法。
首先在结构上文件柜与档案柜就有着很大区别，文件柜的结构更轻薄，结构的设计也更加简约，通常不会有太过复杂的设计结构，因此文件柜通常被称为铁皮文件柜。但档案柜是不同的，为了确保档案柜内的文件安全，并可以长期存储还考虑柜内温度、湿度等多种情况。因此档案柜的设计结构更为复杂与多样。
其次文件柜，则以方便取阅、分类存放，对保密性相对低些（如，比档案的要求低些），所以文件柜门可以是玻璃门或木门等方式结构（有些还不设锁以方便工作）。档案柜，一般用于长久存放，柜门关闭后，别人看不到内部物品，柜门有锁，对保密性要求高。所以一般以铁柜（铁门）结构，安全性好。
总之，文件柜和档案柜的区别并不是不大，它们的款式也没什么太大的差别，不过是用途上的叫法不同罢了。
